要避免论文查重的负面效应，首先需要了解论文查重的原理和目的。论文查重是为了检测论文中是否存在抄袭和剽窃行为，以维护学术诚信和保证研究质量。然而，过度依赖查重系统可能会带来一些负面效应，如误判、资料重复使用等问题。下面从几个方面了解下如何避免这些负面效应。

首先，要避免误判，研究者应该主动提前了解和学习论文写作规范和引用规则。合理引用他人的研究成果，正确标注引用来源，可以减少查重系统对论文的相似度判断，避免因为引用而被错误判定为剽窃。

其次，在撰写论文时，应注重文献综述和创新性的深入分析，以避免简单堆砌他人观点和文字，降低相似度。研究者应该将重点放在自己的创新性研究上，以确保论文内容有独特性和原创性。

同时，在使用查重系统之前，作者可以利用一些本地查重工具或自行进行重复检查。这样可以提前发现和修改自己论文中的相似度较高的内容，避免被查重系统误判。

此外，研究者还可以主动与导师或其他专业人士进行讨论和交流，寻求他们对论文内容的意见和建议。经过一些修改和调整，论文的独特性和原创性将更加突出，避免被查重系统视为抄袭。

最后，研究者还可以尝试在论文中加入一些自己的思考和见解，展示自己的独立思考能力和创新思维。这样不仅能够降低相似度，还能够增加论文的学术深度和观点独特性。

综上所述，避免论文查重的负面效应需要研究者主动学习并遵守写作和引用规范，注重原创性和独立思考，在使用查重系统之前进行自查和修改，寻求专业人士的意见和建议等。这样可以提高论文的独特性和原创性，减少被查重系统误判的可能性。